Разогрейте духовку до 180 °C. Формочки для маффинов выложите квадратиками пергамента, чтобы углы выступали над краями формочек.
Смешайте в миске венчиком цельнозерновую и обычную муку, разрыхлитель и сахар. Добавьте изюм и половину тыквенных семечек. Перемешайте.
В другой миске разомните вилкой банан, добавьте растительное масло, молоко и яйца. Смешайте до однородности. Добавьте мучную смесь и замесите комковатое тесто.
Разложите тесто по формочкам, посыпьте оставшимися тыквенными семечками. Выпекайте 20 минут, пока деревянная шпажка, вставленная в центр маффина, не будет выходить сухой.
Остужайте в формочках на решетке 5–7 минут, затем переложите маффины на решетку, полностью остудите и подавайте.